在某个岛上，
有一座规模略小的图书馆。
它是专门为了某个少女而建造的，
遊行寺家的私人图书馆。
图书馆里有很多很多罕见的书物，
如果是书虫的话，
就绝对不会存在比这里还更加爱不释手的地方。
而，在这般首屈一指的私人图书馆里，住着几位出众且愉快的住人。
热爱图书的尼特少女·遊行寺夜子。
毒舌，冷淡的妹妹·月社妃。
借住于图书馆的天然少女·伏見理央。
还有一位被这背后的秘密而吸引过来的侦探少女·日向かなた。
宛如被引导着，他们互相邂逅——随后又以“喜爱书”的契机，开始了属于他们的青春。

一开始的图书馆虽然寂寞单调，可自主人公一行人住进来开始，这座图书馆就变得渐渐热闹了起来。
在不知不觉中——他们之间的关系变的亲密起来，达到了所谓青梅竹马的程度。
时光飞逝，2年后。因家庭原因，主人公离开了这座岛屿。
而这次，主人公久违的回到了那座图书馆。

与记忆中的6年前一模一样，无论是图书馆，还是亲爱的青梅竹马们。
可是，那在6年前未曾得知的“图书馆的秘密”，这次却等待着主人公去揭晓它。
【——出现在书中之事，会在现世中再现。
无论那是何等荒谬之事。】
如果是酸酸甜甜的恋爱系小说的话，那就会发生宛如飘渺的爱情罗曼史。
又假如那是惊讶重重的幻想系小说的话，到了明天就会有吸血鬼出现在你的面前。
而碰到了略惊悚的恐怖系物语的话，你的身后就会有幽灵在向你招手。
【这就是所谓的“魔法书物”。】
这是一个被小清新的青春与苦闷焦躁的感情动摇的，某个小而又小图书馆的物语……
去将遊行寺夜子的逞强。
去将月社妃的可爱。
去将伏見理央的坚强。
去将日向かなた的耀眼感。

准备好——来一场你与书的恋爱吧。

2036年2月6日15时28分15秒...
世界上所有的电脑，由于超出了自1900年开始计算的数字标准时间上限值42亿9496万7295秒，
导致全球防卫攻击系统陷入误操作这一最糟糕的事态。
军事卫星的咆哮如同神之铁锤一般倾注在地上，瞬间毁灭了世界上最主要的都市。
纽约、伦敦、上海、莫斯科以及新宿。
这就是后来被称作“失落之晨”的大规模灾害。
这场灾害，是否就是对人类实施的制裁呢？若是的话，施加制裁的究竟是何人？
还是说，这只不过是更加惨烈的灾厄的序章？
在混乱的趋势逐渐诞生之时，匿名代码的故事开幕了。
舞台是2037年的东京都，中野区。
「——将神，黑掉吧！」


2037年、東京・中野。2036年2月6日に発生した世界的大災害「サッド・モーニング」による被害を免れたこの地で、主人公・高岡歩論（ポロン）は、親友の弓川十字（クロス）とともに、ハッキングの仕事をこなして生活を送っていた。

そんなある日、些細な言い訳から相手不在の「駆け落ち」を宣言したポロンは誰も居ないはずの待ち合わせ場所で謎の少女“モモ”と出会う。

直後、モモを追って現れる謎の襲撃者たち。

逃走劇の最中、ポロンはまるでゲームのように時を記録しやり直すことが出来る「セーブ＆ロード」アプリを入手し窮地を脱することに成功するが、それは更なる事件の幕開けに過ぎなかった……

解決不能事件「クエスト」を次々と仕掛ける謎の天才ハッカー「Cicada3301」。
凍結されたはずの地球シミュレータを復活させた「垓機関」。
そして影で暗躍するバチカン「５１３聖務室」の刺客たち。

ポロンはモモとの出会いをきっかけに様々な思惑に巻き込まれ、世界を揺るがす大事件に立ち向かうことになる。

ハッキング、そして「セーブ＆ロード」を駆使して立ち向かった先に待ち受ける真実とは？

無数に分岐する現実を「ハッキング」し、世界を救う結末を“ロード”せよ！

これは、未来を書き換える“ハッカー”たちの物語。

主人公大藏游星，作为代表了日本财界的“华丽一族”的大藏家的末端，其出生就被寄予厚望。

在优秀的亲人与家庭教师身边被严格培育的游星，虽然各方面都很优秀，但换句话说也不过是一只笼中鸟，过着与普通人的梦想与希望毫无关系的生活。

就在这时，游星首次得到了一个脱离家族的监视、独自来到外面的世界的机会。

他化身为毫无名气的庶民女子小仓朝日，隐藏自己的身份潜入了上流阶层的子女云集的服饰专修机构『菲利亚女子学院』。

作为相关一环，游星（朝日）将以侍候学院第一的超级同级生、樱小路露娜的女仆身份，在她所住的『樱公馆』劳作。

也因此，他还会在那里与跟露娜有关系的一众学院生同住。

一位是来自瑞士的高傲留学生，尤希尔。
一位是继承传统花道系谱的大和抚子，花之宫瑞穂。
另外一位，则是在主人公少年时代喜欢上他的庶民派社长千金，柳之濑凑。
再加上一众独具个性的大小姐，以及跟随她们的超个性的侍者，更让游星（朝日）的生活波澜万丈。

最终，游星能否一直伪装着身份（主要是性别），平安度过公馆与学校的双重生活中呢？